Petsc需要blas, lapack, mpi。blas和lapack可以用atlas+lapack整合的方式，mpi（mpich2或者openmpi）必须用源程序编译安装。
configure -prefix=/opt/mpich2 |& tee c.txt
make 2>&1 | tee m.txt
atlas+lapack的方法在ATLAS Installation Guide可以找到。
目前在Petsc上配置的软件包：
./configure –with-blas-lapack-dir=/opt/atlas/lib –with-mpi-dir=/opt/mpich2 –with-scalar-type=complex –with-clanguage=c –with-fortran-kernels=generic –download-scalapack=1 –download-mumps=1 –download-superlu=1 –download-plapack=1 –with-debugging=0 –download-fftw=1 –download-blacs=1 –download-parmetis=1 –download-blopex=1
目前FFTW包的路径与petsc中用的不相符，需要手动下载，然后以–download-fftw=/home/……/fftw-3.3.2.tar.gz参数告诉configure